海军博物馆主要分为室内、海上和陆上三大展区，在室内展区设置的人民海军历史基本陈列，紧紧围绕向海图强鲜明主题，分为艰苦创业、扬帆启航改革开放、乘风破浪强国强军、挺进深蓝三个部分。